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依財政部台財稅字第09804570160號令修正發布之「各類所得扣繳率標準」第二條第一項和第三條第二項規定：
一、公司，可按下列二種方式，擇一幫員工(境內居住者，居住滿183天)扣繳薪資所得稅：
(1)按全月給付總額，依「薪資所得扣繳稅額表」扣繳。
(2)按全月給付總額，扣取5%。
PS：兼職所得及非每月給付之薪資，公司得按給付額扣取5%薪資所得稅，免併入全月給付總額扣繳。
二、公司員工為境外居住者(例：外籍人士)，在境內居住未滿183天。
(1)在行政院核定每月基本工資1.5倍以下者，按給付額扣取6%。
(2)在行政院核定每月基本工資1.5倍以上者，按給付額扣取18%。
(3)須於給付後10日內，向國稅局申報所得。
PS：
(1)101/01/01起基本工資每月為18,780，即18,780*1.5=28,170
(2)102/04/01起基本工資每月為19,047，即19,047*1.5=28,571
三、舉例：102/05/01，甲君薪資5萬，台灣桃園人，無扶養親屬；乙君薪資7萬，台灣台北人，扶養親屬1名；丙君薪資3萬元，馬來西亞人，無扶養親屬。試問每位薪資所得須扣繳多少？(PS：公司依「薪資所得扣繳稅額表」扣繳，102年依薪資所得扣繳稅額表，起徵點為69,501以上)
(1)甲君=50,000<69,501，代扣繳薪資所得稅為0。
(2)乙君=70,000<77,001，代扣繳薪資所得稅為0。(因乙君扶養親屬1名，故起徵點由69,501變為77,001)
(3)丙君=30,000>28,571，代扣繳薪資所得稅為5,400(30,000*18%)